搦手口

駐車場から城跡へと向かう途上にある搦手口（からめてぐち）、城の大手口（追手）に対し裏口に当たる。長野氏時代から北条氏時代までは、当時の情勢から考え、ここが大手口であったが、井伊氏時代になると城の南方に城下町が構成され、大手口が南面に設けられ、ここが搦手口となったといわれている。

大堀切

箕輪城を南北に分断する空堀、堀の南側が落とされても城の主要部を守ることができるようになっている。幅は最大30〜40m、深さは20mを超える。大堀切の中央付近で、たった一つの土橋が架かっている（写真の手前が大堀切、その奥が土橋）。
堀切（ほりきり）＝山城において、敵が尾根伝いに侵入するのを防ぐために、山の尾根筋を断ち切るように等高線と直角に掘った空堀。

郭馬出西虎口門

本丸から、大堀切に架かる土橋を渡ると郭馬出（かくうまだし＝南側に出撃する拠点）、その西虎口門（にしこぐちもん）が平成28年（2016年）に復元整備された。礎石の配置から 二階建て櫓門として復元、屋根は板葺き、左右の塀には狭間が見られる。関ヶ原の戦い以前の城郭で復元された城門の中では全国最大規模。

郭馬出土橋

箕輪城を南北に分断する大堀切を唯一渡ることができる土橋、奥の二の丸から手前の廓馬出へと渡ることができる。土橋は、築城時以降、数時期に渡って改修され、土橋南西側の裾に石垣を築くなどの改修が行われていた。写真左下にその石垣が復元されている。

空堀（本丸北側）

写真左側の本丸と右側の御前曲輪（ごぜんくるわ）の間の空堀、東部が浅くし西部が深くなっていて、西の空堀に下りる通路になっていたと考えられている。

木橋（蔵屋敷～本丸）

蔵屋敷（くらやしき）と本丸のある間にある空堀に架かっていたと推測される木橋（きばし）、長さ28.92m、幅2.40m、高さ6.00mの規模。発掘調査で発見された16世紀末の橋脚礎石の位置や高崎城の絵図を参考に復元された。

本丸西虎口門

蔵屋敷から本丸へと架かる木橋を渡った先にある虎口、発掘調査から、一階建て高麗門と推定され、木造で復元された。 桁行は2.94mと、本丸に存在する3つの門の中で最大幅を誇り、本丸門の中で唯一木橋を渡って進入する構造から、重要な出入口であったと推測される。屋根は板葺き、左右の塀に狭間が見られる。

本丸跡

南北約100m、東西約70m、東側（写真奥）には高い土手を築いて、城内が敵に見えないようにしてある。この土手が写真左奥の御前曲輪（ごぜんくるわ）の東側まで続いていることにより、御前曲輪も本丸の一部であったと考えることができる。御前曲輪は本丸の詰めにあり、城の精神的な中心であった。