東虎口櫓門（ひがしこぐちやぐらもん）

東側の城の出入り口、昭和24年（1949年）に南櫓と北櫓が復元され、平成6年（1994年）に城門が復元され、東虎口櫓門の姿がよみがえった。

真田石（さなだいし）

真田昌幸(幸村の父)が上田城築城の際、北方にそびえる太郎山から掘り出した大石で、「真田石」と名付けられた。上田城の石垣の大部分は太郎山の緑色凝灰岩が使われている。

北櫓(きたやぐら)

本丸には櫓門２棟、櫓７棟あったが、現在は櫓門１棟、櫓２棟が現存している。北櫓は、南櫓とともに明治維新後に売却されたが、市民の熱意で買い戻され、昭和18年から24年にかけて移築された。格子窓に突き上げ戸がついた「武者窓」や、矢や鉄砲を放つための「矢狭間（やざま）」「鉄砲狭間（てっぽうざま）」が設けられている。

西虎口櫓門（にしこぐちやぐらもん）跡

城壁の凹部は櫓の梁（はり）を固定したくぼみで、西虎口櫓門があったという証拠の一つになっている。

隅おとし（すみおとし）

本丸土塁（土を盛り上げた部分）の北東（丑寅＝うしとら）の隅を切り込み、「鬼門よけ」としたもの。上田城の特徴の一つになっている。

尼が淵（あまがふち）

築城当時、城の南側に千曲川が流れ、穏やかで深みのある流れが天然の堀になっていた。この場所を「尼が淵（あまがふち）」と称していた。右側の櫓は南櫓、左奥の櫓は西櫓。

南櫓（みなみやぐら）

北櫓とともに明治維新後に売却されたが、買い戻され、昭和18年から24年にかけて移築された。現存する３棟の櫓は同じ規模で、屋根は入母屋造り、本瓦葺き。

西櫓（にしやぐら）

尼が淵の河岸段丘上に築かれた本丸隅櫓、江戸時代初期に建てられたまま現存している。外壁は下見板（板張り）とし、その上が塗籠（ぬりごめ）になっている。寒冷地の城によく見られ、城郭建築の初期の様式ともいわれている。